博士阶段可以申请的奖学金有五种：

1. 第一种是文部科学省的国费留学生奖学金，这个奖学金会分别按照A类校和B类校来进行评审，A类20人，B类10人，而且要求各年级均衡（博士，修士，学部），各国籍均衡，难度比较大。

2. 第二种是China Scholarship Council（简称CSC）国家留学基金委为建设高水平大学公派研究生设置的项目，国内在读的硕士和国外在读硕士都可以申请。

3. 第三种是JSPS日本学术振兴会特别研究员奖学金。JSPS对日本科研机构的资助非常庞大，给博士的奖学金“特别研究员”博士奖学金一个月可以获得约20万日元。

4. 第四种是日本的5年一贯硕博连读项目。如果在硕士入学时就有在日本读博的打算，那么可以多关注一下这个项目。申请条件之一就是硕士毕业不可以就职，只能升学，所以申请人数不多，申请难度小。

5. 最后一种是各学校的私费留学生奖学金。这需要同学入学后，关注留学生事务所或者学生科的关于奖学金申请的信息，根据具体的申请要求，在申请时间内按要求完成材料递交等的动作。

除了以上5种给付型奖学金，日本的国公立大学针对留学生基本都会有学费减免的政策。国公立大学的学费一年约4万人民币，留学生只要成绩保持优良，基本可以拿到50%的学费减免。

根据学生生活所在地不同，生活费有部分差异。例如，关东地区大约每个月15万日元左右，四国地区只需要每月11万左右。由于博士生一般会在校内担任TA等研究室职务，或其他兼职，所以每月收入基本可以覆盖自己的生活费。